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Programa InfoSalud (Argentina)

Una herramienta online facilita el monitoreo de la pandemia de Covid-19 en Brasil

Publicado em 22 março 2021

Por Elton Alisson, da Agência FAPESP

Investigadores de las universidades de San Pablo (USP) y de Chile desarrollaron una herramienta online de georreferenciamiento que facilita la vigilancia de epidemias, como la de Covid-19, al permitir visualizar la geolocalización a lo largo del tiempo de casos de infección, muerte o personas vacunadas contra la enfermedad en Brasil. De esa forma, la plataforma posibilita a los gestores de salud rastreas brotes o la distribución de vacunas en diferentes niveles, como en un Estado, ciudad, barrio, calle o aún mismo en un edificio residencial.

Desarrollada con el apoyo de FAPESP, la herramienta, llamada Outbreak, está disponible de forma gratuita y fue descripta en un artículo publicado en la plataforma arXiv, aún sin revisión por pares.

“La herramienta fue creada para facilitar la visualización de datos epidemiológicos por gestores de salud y, así, ayudarles a identificar dinámicamente cambios en la evolución de la epidemia, así como aumentos en el número de infectados en una región, rastrear brotes en tiempo real y tomar decisiones para minimizar los efectos”, dijo a la Agencia FAPESP, Helder Nakaya, vicedirector de la Facultad de Ciencias Farmacéuticas (FCF-USP) y coordinador del proyecto.

Según el investigador, ya existen paneles epidémicos basados en la web que muestran conjuntos de datos de vigilancia de la pandemia de COVID-19, como los construidos por las universidades de Harvard, Johns Hopkins y Virginia en los Estados Unidos, y por la Organización Mundial de la Salud (OMS). Aunque la mayoría usa datos de código abierto, se ejecuta en plataformas propietarias, que a menudo son costosas y difíciles de construir y requieren habilidades informáticas específicas. Además, no permiten que los usuarios ingresen datos.

Para superar estas limitaciones, la plataforma Outbreak permite que incluso los usuarios no expertos ingresen datos de manera más conveniente y en una plataforma más fácil de usar.

“Cualquier conjunto de datos, como los proporcionados por la OMS, el Ministerio de Salud, las secretarías estaduales o los recopilados por una Unidad Básica de Salud [UBS], se pueden insertar en la herramienta para visualizarlos dinámicamente, utilizando mapas y animaciones, y conrepresentación gráfica de la línea de tiempo y geolocalización de los casos de infección, muerte o vacunación, por ejemplo ”, dice Nakaya.

En el sitio web de la herramienta hay un tutorial en texto y en video con una descripción detallada de cómo usarla.

Los datos a insertar en la herramienta deben estar disponibles en un archivo de texto delimitado por tabuladores, como una planilla de Excel, con columnas fijas con indicaciones de las coordenadas geográficas (latitud y longitud), fecha y casos de personas infectadas, muertas o vacunadas contra el COVID-19, por ejemplo.

A partir de estos datos, los tomadores de decisiones y los epidemiólogos pueden verificar la evolución geográfica de los casos a lo largo del tiempo y clasificarlos por criterios como etnia, sexo y edad, entre otros.

Para que los conjuntos de datos sean gráficamente claros para la exploración, la herramienta permite a los usuarios aplicar diferentes colores para cada variable de interés y usar la función de zoom para tener una visión más refinada.

“Es gestor de una UBS puede insertar en la herramienta una hoja de cálculo con la dirección de las personas diagnosticadas o vacunadas contra COVID-19 en su región de operación, por ejemplo, y verificar a través de la plataforma dónde están apareciendo nuevos casos de la enfermedad o dónde tiene menos personas vacunadas y enviar agentes de salud para intervenir en el lugar”, dice Nakaya.

Epidemiología digital

Además de ayudar en el seguimiento de epidemias, Outbreak se puede utilizar para tratar cualquier tipo de datos y estudios, como poblaciones o migración animal.

La herramienta es uno de los medios que han utilizado los investigadores del Laboratorio de Biología de Sistemas Computacionales de la FCF-USP, dirigido por Nakaya, para explorar un área de estudios denominada epidemiología digital. El nuevo campo se caracteriza por la incorporación de tecnologías digitales para analizar factores que determinan la frecuencia y distribución de casos de enfermedades.

A través de la historia de la ubicación de teléfonos celulares, los investigadores del laboratorio analizaron los patrones de movilidad durante la pandemia de COVID-19 en Brasil y monitorearon, en tiempo real, la adherencia de la población a las medidas de distanciamiento social.

“A través de estos datos, que son proporcionados por los propietarios de los teléfonos móviles de forma voluntaria, es posible correlacionar la movilidad con la transmisibilidad de la enfermedad”, dice Nakaya.

Más recientemente, dos estudiantes de doctorado del laboratorio iniciaron un proyecto en el que analizaron los temas más buscados en Google al inicio de la pandemia COVID-19 en Brasil y en la segunda y tercera oleada de la enfermedad en el país.

Los análisis, aún no publicados, revelaron que al inicio de la pandemia en el país, en marzo de 2020, los temas más buscados por la población brasileña eran sobre actividades para hacer en casa, como aprender a tocar un instrumento musical, un idioma y a coser o cocinar. Con el avance de la pandemia, la búsqueda de estos temas ha ido disminuyendo progresivamente.

“Cuando comenzaron a aparecer los primeros casos de muerte por la enfermedad en Brasil, la gente empezó a buscar realmente cosas para hacer en casa. En la segunda y tercera ola de casos, el interés por las actividades para entretener en casa ha disminuido mucho y aumentó la circulación de personas en las calles”, dice Nakaya.

También se analizaron datos sobre la cantidad de automóviles que pasaron por peajes al principio y después de la evolución de la enfermedad en el país. Los análisis indicaron que, al inicio de la pandemia en el país, la circulación de autos en el país disminuyó mucho, y luego de un tiempo los vehículos comenzaron a circular por las carreteras a los mismos niveles que antes.

"La idea es que estos datos obtenidos a través de tecnologías digitales puedan ser traducidos por los administradores de salud en acciones para controlar la epidemia", dice Nakaya.

El artículo "Outbreak: a user-friendly georeferencing online tool for disease surveillance", de Raúl Arias-Carrasco, Jeevan Giddaluru, Lucas E. Cardozo, Felipe Martins, Vinicius Maracaja-Coutinho y Helder I. Nakaya, puede leerse en la plataforma arXiv en https://arxiv.org/abs/2004.10490.

Traducción Programa INFOCIENCIA