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Blog da Elena Aparecida dos Santos

Montada sequência de genoma mais completo da cana

Publicado em 06 dezembro 2019

Por André Julião | Agência FAPESP

Um grupo internacional de pesquisadores liderados por cientistas brasileiros montou a sequência mais completa do genoma da cana comercial. Eles mapearam 373.869 genes, ou 99,1% do genoma total, feito que é o resultado de quase 20 anos de pesquisa e servirá de base para o melhoramento genético da maior safra mundial em tonelagem, de acordo com a Organização das Nações Unidas para Agricultura e Alimentação (FAO).

Um artigo que descreve o estudo é publicado no GigaScience. Seus autores principais são Glaucia Mendes Souza, professora titular do Instituto de Química da Universidade de São Paulo (IQ-USP) e membro do comitê diretor do Programa de Pesquisa em Bioenergia da FAPESP (BIOEN-FAPESP), e Marie-Anne Van Sluys, professora titular do Instituto de Biociências da mesma universidade (IB-USP) e membro do Painel Adjunto de Ciências da Vida da FAPESP.

"É a primeira vez que todos os genes da planta de cana-de-açúcar, ou a grande maioria, são vistos. Em projetos anteriores de vários grupos de pesquisa, as sequências tiveram que ser colapsadas por falta de uma ferramenta de montagem adequada, então eram apenas uma aproximação ", disse Souza. "Esse conhecimento abre muitas possibilidades, desde aplicações em biotecnologia até aprimoramento genético e edição de genes [substituição ou eliminação de genes com funções específicas]", completa Van Sluys.

Como os pesquisadores explicaram, os híbridos comerciais de cana-de-açúcar de hoje são criados há milhares de anos cruzando diferentes variedades de duas espécies (Saccharum officinarum e S. spontaneum) e possuem um genoma altamente complexo que compreende 10 bilhões de pares de bases em 100-130 cromossomos. Sequenciar o genoma não é tarefa fácil, exigindo um poder computacional substancial para reunir os fragmentos de DNA, mantendo os cromossomos homólogos separados.