Génomes décryptés et relations généalogiques reconstituées
La très faible diversité des Arabicas cultivés, à travers ses deux lignées historiques – Typica et Bourbon – et leurs variétés dérivées, rend sa production particulièrement sensible aux risques climatiques ou sanitaires. Afin d’éclairer les spécialistes de l’amélioration des variétés modernes, des scientifiques de 18 pays, collaborant à l’initiative de l’IRD et de Nestlé, se sont attaqués au séquençage des trois génomes (Arabica et ses parents sauvages). Il leur a fallu dix ans pour démêler, dans leur bagage génétique, les épisodes qui ont conduit aux dix variétés les plus connues comme le Bourbon Pointu, le Moka ou le Blue Mountain, et leurs apparentées. ” Cela n’aurait pas été possible sans le partenariat de longue date avec l’Ouganda, le Brésil et la Colombie. souligne Valérie Poncet, généticienne à l’UMR DIADE. Ainsi, l’individu séquencé de C. eugenioides vit dans les forêts ougandaises où il coexiste encore avec C. canephora, deux espèces étudiées avec nos partenaires du NARO. Quant à C. arabica, c’est le Natural History Museum de Londres qui a fourni le spécimen d’herbier qui a permis à Linnaeus de définir l’espèce. » Concernant l’Arabica, la principale difficulté était de séquencer les deux sous-génomes hérités des parents et de les distinguer en les comparant aux génomes actuels de ses deux espèces parentales. ” Cela a été rendu possible par l’accès à des individus exceptionnels issus des collections vivantes.? Collections réalisées dans les années 70 de l’IRD », ajoute Romain Guyot, généticien de l’UMR DIADE et autre co-auteur. Les scientifiques notent que « aucun des deux sous-génomes ne domine l’autre en termes d’expression ; C. arabica est le résultat d’une parfaite coopération entre les deux parents « . Sa qualité gustative serait due à cet équilibre.