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IMT encontra variante brasileira do novo coronavírus em 93% dos casos analisados em Araraquara

Publicado em 03 março 2021

Por G1 São Carlos e Araraquara

Um estudo do Instituto de Medicina Tropical da Universidade de São Paulo (IMT-USP) identificou a variante brasileira do novo coronavírus P.1 em 93% dos casos analisados em Araraquara (SP).

Os dados preliminares mostram que a variante, identificada primeiro em Manaus (AM), já é predominante no município. Oficialmente foram confirmados 29 casos.

A prefeitura acredita que a P.1. tenha relação com a alta de casos, internações e mortes por Covid-19 na cidade, que tem medidas restritivas de circulação desde o dia 21 de fevereiro para conter a disseminação.

Somente nesta terça, foram confirmadas mais 7 mortes, somando 224. Mais 115 casos da doença foram registrados, somando 14.969. A ocupação dos leitos de UTI caiu pela primeira vez em 9 dias e está em 86%.

Análise

Foram analisadas 57 amostras de secreção nasofaríngea coletadas de pacientes que tiveram o diagnóstico confirmado entre os dias 25 de janeiro e 23 de fevereiro de 2021 em uma Unidade Básica de Saúde (UBS).

Os testes revelaram que 53 amostras tinham a presença da variante, considerada cerca de duas vezes mais transmissível que sua predecessora, a B.1.128. Ela também pode driblar o sistema imune de indivíduos já infectados pela Covid-19 e causar uma nova infecção.

“Até 17 de fevereiro ainda encontramos alguns casos de infecção por outras linhagens. A partir daí foi tudo P.1.”, afirmou a coordenadora da investigação, Camila Romano, em entrevista à Agência Fapesp.

O trabalho integra um projeto apoiado pela Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (Fapesp), com o objetivo é avaliar a transmissão domiciliar do novo coronavírus em Araraquara.

Análises

Assim que a P.1. foi detectada na cidade e o sistema de saúde local começou a dar sinais de colapso, com UTIs lotadas, o grupo do IMT-USP entrou em contato com colaboradores para obter amostras de moradores e tentar medir a prevalência da variante.

As primeiras análises foram feitas com material de 22 pacientes hospitalizados e os pesquisadores sequenciaram o RNA do vírus em 14 amostras, sendo que 12 deram positivo para a P.1.

O passo seguinte foi avaliar as amostras da comunidade, ou seja, de pessoas atendidas em UBS e que não necessariamente apresentam comorbidades (doenças pré-existentes) ou evoluem para casos graves – o que permitiria obter um retrato mais representativo da população.

Para tornar o processo de análise mais rápido e barato, o grupo do IMT-USP desenvolveu uma metodologia que dispensa o sequenciamento do genoma viral.

“Desenhamos um novo ensaio de RT-PCR, similar ao que é usado para diagnóstico, mas capaz de diferenciar quais casos positivos de COVID-19 estão relacionados à linhagem P.1.”, explicou a pesquisadora.

Segundo a pesquisadora, essa estratégia foi possível porque a variante brasileira apresenta, em um gene denominado NSP6, uma mutação-chave similar à observada nas variantes mais transmissíveis detectadas no Reino Unido (B.1.1.7) e na África do Sul (B.1.351). Esse gene codifica uma proteína que participa dos processos de replicação viral e a mutação é caracterizada pela deleção de três aminoácidos, ou seja, pela perda de nove nucleotídeos.

Vantagem adaptativa

Ainda segundo a pesquisadora, as mutações na proteína spike, que se liga ao receptor da célula humana para viabilizar a infecção, parecem conferir uma importante vantagem adaptativa ao vírus, que agora consegue se disseminar ainda melhor.

Estudo do Centro Brasil-Reino Unido para Descoberta, Diagnóstico, Genômica e Epidemiologia de Arbovírus (CADDE) – que também colaboram neste estudo – indica que a variante brasileira emergiu em novembro de 2020 e em apenas sete semanas se tornou revalente em Manaus (AM).

“Ainda não sabemos quando exatamente a P.1. entrou em Araraquara e estamos analisando amostras mais antigas para tentar descobrir. Mas os dados que temos até agora sugerem que também nessa cidade ela se tornou a mais prevalente em menos de dois meses”, afirmou a pesquisadora.

“É incomum uma linhagem emergente substituir completamente outra já estabelecida em tão pouco tempo, ainda mais quando há um foco epidêmico ativo e um grande número de indivíduos já infectados. É assustador e mostra o poder desse vírus", disse.

Araraquara confirmou casos da variante em 15 de fevereiro. No mesmo mês, a cidade bateu recorde de mortes por Covid-19. Em 3 dias de março já são 19 mortes pela doença. (veja abaixo o gráfico).

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