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Jornal de Piracicaba

Fapesp cria repositório com dados de 75 mil pacientes para subsidiar estudos

Publicado em 19 junho 2020

Por Governo do Estado de São Paulo

Pesquisadores de universidades e instituições de pesquisa de todo o Brasil passaram a ter acesso ao covid- 19 Data Sharing/BR, o primeiro repositório do país com dados demográficos e exames clínicos e laboratoriais de pacientes que fizeram testes para covid-19 em unidades laboratoriais e hospitais do estado de São Paulo. O objetivo é compartilhar informações clínicas de pacientes anonimizados para subsidiar pesquisas científicas sobre a doença nas diversas áreas de conhecimento. A base de dados compartilhados é resultado de uma iniciativa da Fapesp (Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo), em parceria com a USP (Universidade de São Paulo), e já conta com a adesão de hospitais e unidades laboratoriais de atendimento a pacientes. A parceria reúne, nesta primeira etapa, o Grupo Fleury e os hospitais Sírio-Libanês e Israelita Albert Einstein, que disponibilizaram informações, infraestrutura, tecnologias e recursos humanos próprios para viabilizar o compartilhamento de dados. A Fapesp está convidando outras instituições de atendimento a pacientes para compartilhar informações no repositório covid-19 Data Sharing/ BR.

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O repositório (https://repositoriodatasharingfapesp. uspdigital.usp.br/) abrigará, inicialmente, informações anonimizadas de 75 mil pacientes, 6.500 dados de desfecho e um total de mais de 1,6 milhão de exames clínicos e laboratoriais realizados na cidade de São Paulo pelo Grupo Fleury e os hospitais Sírio-Libanês e Israelita Albert Einstein desde novembro de 2019. Ainda que o primeiro caso da doença no Brasil tenha sido registrado em fevereiro, pelo Hospital Albert Einstein, o período de cobertura dos dados permitirá que as pesquisas analisem o histórico de saúde dos pacientes bem como busquem evidências de sintomas da enfermidade em pacientes atendidos anteriormente. Novos dados serão inseridos pelo Grupo Fleury, Hospital Sírio- Libanês e Einstein regularmente.

O repositório disponibilizará aos pesquisadores três categorias de informação: dados demográficos (gênero, ano de nascimento e região de residência do paciente) e dados de exames clínicos e/ou laboratoriais, além de informações, quando disponível, sobre a movimentação do paciente, como internações e desfecho dos casos, como recuperação ou óbitos. Em uma segunda etapa, que já sendo fomentada pela iniciativa, o covid-19 Data Sharing/ BR abrigará também dados de imagens, como radiografias e tomografias. O lançamento do repositório tem um cronograma de três etapas. Uma versão pequena do conjunto de dados foi disponibilizada na última quarta-feira (17), para um período piloto de consultas. A comunidade de pesquisa poderá baixar os dados e começar a programar técnicas de ciência de dados para leitura, visualização e análise.

ORIGEM DO REPOSITÓRIO

A ideia de criação do repositório covid-19 Data Sharing/ BR surgiu há pouco mais de um mês e foi concretizada rapidamente graças a outro projeto lançado pela Fapesp no fim do ano passado, a Rede de Repositórios de Dados Científicos do Estado de São Paulo. A rede, que levou quase três anos para ser desenvolvida, disponibiliza em uma plataforma aberta dados associados a pesquisas científicas desenvolvidas em todas as áreas de conhecimento no Estado de São Paulo. A mesma plataforma abrigará também o repositório covid-19 Data Sharing/BR. O desenvolvimento da rede, que inclui um buscador de metadados, contou com o envolvimento das seis universidades públicas do Estado de São Paulo, a Unicamp (Universidade Estadual de Campinas), USP (Universidade de São Paulo), Unesp (Universidade Estadual Paulista), UFSCar (Universidade Federal de São Carlos), UFABC (Universidade Federal do ABC) e Unifesp (Universidade Federal de São Paulo), o ITA (Instituto Tecnológico de Aeronáutica) e a CNPTIA/Embrapa (Embrapa Informática Agropecuária).

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