A Fapesp (Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo) investiu, em 2008, R$ 638 milhões no apoio a pesquisa, maior desembolso na história da fundação e 16% superior ao realizado em 2007. De 2001 a 2008, a Fapesp investiu R$ 3,9 bilhões em projetos de pesquisa. Esse desempenho acompanha a evolução da transferência de 1% da receita tributária do Estado de São Paulo para a Fundação, conforme determinado pela Constituição Estadual. No período, a soma de recursos provenientes das transferências do Tesouro do Estado foi de R$ 3,3 bilhões, passando de R$ 271,4 milhões, em 2001, para os R$ 623,4 milhões em 2008.