Más de 100 cepas diferentes de la nuevo coronavirus (Sars-CoV-2) llegó a Brasil entre los meses de febrero y marzo de 2020, pero solo tres de ellos, muy probablemente de Europa, continuaron expandiéndose en el país y originaron los más de 805 mil casos confirmados de Covid-19 hasta el 12 de junio.
Estas tres versiones surgieron en los estados de São Paulo y Río de Janeiro entre el 22 y el 27 de febrero. Su transmisión comunitaria ya se había establecido a principios de marzo, antes de que las agencias de salud recomendaran la restricción de los viajes aéreos y la adopción de «intervenciones no farmacológicas» (NPI) para contener la propagación del virus.
El Ministerio de Salud reguló el 13 de marzo los criterios de aislamiento social y cuarentena, que fueron implementados por gobernadores y alcaldes aproximadamente una semana después. Las fronteras terrestres se cerraron el 19 de marzo y la entrada de extranjeros por vuelos internacionales se restringió solo el 27 del mismo mes.
Las declaraciones son de un estudio respaldado por Fapesp y publicado en la plataforma. medRxiv, aún sin revisión por pares. Esto limita las conclusiones a extraer de la encuesta.
“Nuestros resultados muestran la existencia de dos fases de la epidemia en el país. El primero es para la transmisión a corta distancia, dentro de las fronteras estatales de São Paulo y Río. A principios de marzo, comenzó la fase dos, de larga distancia. En otras palabras, las personas infectadas en estos dos estados ya estaban llevando el virus a otras regiones del país cuando se adoptaron los NPI «, dice el investigador Ester Sabino, del Instituto de Medicina Tropical de la Universidad de São Paulo (IMT-USP), un coordinadores de investigación.
Para llegar a estas conclusiones, los científicos utilizaron un modelo de transmisión orientado por la movilidad de la población. La información sobre viajes aéreos y muertes confirmadas por Covid-19 entre febrero y abril se cruzaron con datos genómicos de Sars-CoV-2 obtenidos al secuenciar casi 500 muestras recolectadas de pacientes diagnosticados en 21 de los 27 estados brasileños (contando el Distrito Federal ) El trabajo se realizó dentro del alcance del Centro de Descubrimiento, Diagnóstico, Genómica y Epidemiología de Arbovirus Brasil-Reino Unido (CADDE).
A pesar de la fuerte caída en los viajes aéreos nacionales después de mediados de marzo, los investigadores detectaron un aumento del 25% en la distancia promedio recorrida por los pasajeros aéreos en el período. Este hecho, según los autores, coincidió con la propagación de Sars-CoV-2 desde los grandes centros urbanos al resto del país.
«Nuestros resultados arrojan luz sobre el papel de los grandes centros de población altamente conectados en la rápida ignición y el establecimiento del coronavirus y proporcionan evidencia de que las intervenciones actuales siguen siendo insuficientes para mantener la transmisión del virus bajo control en Brasil», dicen los autores en el texto.
El impacto de la cuarentena
Antes de que se adoptaran medidas de aislamiento social, la tasa de contagio de Sars-CoV-2 en Brasil era de alrededor de 3. Esto significa que cada persona infectada transmitió el virus, en promedio, a otras tres personas, lo que favoreció el crecimiento exponencial enfermedad.
Aunque se implementaron cuando se estableció la transmisión comunitaria y el virus ya había cruzado las fronteras de São Paulo y Río de Janeiro, las restricciones de cuarentena lograron, al principio, contener significativamente la propagación de la enfermedad.
El modelo de transmisión orientado a la movilidad muestra que la tasa de contagio alcanzó menos de 1 en las ciudades de São Paulo y Río de Janeiro poco después de la adopción de los NPI. Esto evitó el crecimiento exponencial en el número de casos y el colapso de los hospitales.
Pero, a medida que disminuía la adherencia de la población al aislamiento, la tasa de contagio aumentaba lentamente a valores entre 1 y 1.3, sin disminuir aún más desde entonces. Los expertos en epidemiología dicen que solo cuando la tasa de contagio se estabiliza por debajo de 1 durante algunas semanas, el crecimiento en el número de casos y muertes comienza a disminuir.
A través de análisis de filogeografía, que combinan datos del código genético viral con información del lugar donde ocurrió la transmisión, los investigadores identificaron que 104 cepas de Sars-CoV-2 ingresaron a Brasil, la mayoría de ellas de los Estados Unidos. Del total de genomas secuenciados en Brasil, el 75% pertenecen a tres cepas de origen europeo.
«Es posible que las otras cepas que identificamos no pudieran expandirse porque, cuando ingresaron a Brasil, ya se habían implementado medidas de aislamiento social», dice Sabino.
Como explica el investigador, el genoma Sars-CoV-2 tiene aproximadamente 30,000 pares de bases (que forman las cadenas de ARN virales). Si el virus que infecta a un individuo muta en la posición 200 de la cadena de ARN, por ejemplo, todas las personas infectadas por ese paciente llevarán la misma marca en el genoma viral. «Al cruzar estos datos con información sobre la fecha y el lugar donde se recolectaron las muestras, pudimos rastrear la trayectoria de la epidemia, que todavía está en su infancia», dice Sabino.
Según el investigador, aún será necesario secuenciar más muestras de la región norte del país para determinar, por ejemplo, el origen del linaje que se ha extendido fuertemente por estados como Amazonas y Pará. contribuyó mucho para propagar el virus ”, dice.
En la evaluación de Sabino, este tipo de estudio ayuda a comprender cómo evoluciona una epidemia y cuáles son las principales vías de transmisión. «Este conocimiento puede servir como una lección para que, en una situación futura, las medidas se puedan tomar antes y de manera más efectiva».
* Este contenido es de Agência Fapesp.