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Covid-19 : à Manaus, l’immunité collective a-t-elle montré ses limites ?

Publicado em 25 setembro 2020

Por Paméla Rougerie

C'est une nouvelle étape dans la progression de l'épidémie de Covid-19 au Brésil, un des pays les plus gravement touchés au monde. Les habitants de la ville de Manaus, située dans la forêt amazonienne, auraient atteint un niveau d'immunité collective permettant de contrôler temporairement la circulation du virus, selon une étude menée conjointement par plusieurs chercheurs d'universités brésiliennes, américaines et britanniques.

Cette étude a été menée entre mars et septembre sur des milliers d'échantillons prélevés pendant plusieurs mois et issus de dons du sang dans la région. Elle a été publiée sur medrxiv lundi dernier, mais n'a cependant pas encore été évaluée par un comité de lecture. Selon ses auteurs, 66 % de la population de Manaus possède des anticorps contre le Sars-Cov-2 (contre 0,7 % en mars, au début de l'épidémie).

Un taux qui permettrait de dire que l'immunité collective a été atteinte dans la ville : l'étude rappelle que d'autres travaux estimaient le seuil minimum d'immunité entre 20 % et 43 %, et que les modèles épidémiologiques les plus simples le situaient autour de 60 %.

Une conséquence de l'épidémie hors de contrôle

Grâce à cette immunité, l'épidémie est plus facilement gérable. « Il apparaît que l'exposition au virus lui-même a entraîné une baisse du nombre de nouveaux cas et de décès à Manaus », a déclaré la professeure de médecine Ester Sabino lors d'une présentation de l'étude à la Fondation de soutien à la recherche de l'Etat de Sao Paulo (FAPESP), qui a contribué à financer ses travaux.

La région n'avait pas l'immunité collective comme stratégie. Il s'agit plutôt d'une conséquence d'un manque de contrôle des autorités sanitaires. « L'immunité collective par infection naturelle n'est pas une stratégie, c'est le signe qu'un gouvernement n'a pas réussi à contrôler une épidémie et qu'il en paie le prix en vies perdues », a tweeté Florian Krammer, professeur de microbiologie à l'école de médecine Icahn de l'hôpital Mount Sinai à New York.

Since I already see it going this way: I did not endorse community immunity as a strategy. Community immunity via natural infection is not a strategy, its a sign that a government failed to control an outbreak and is paying for that in lives lost. https://t.co/o0hxHHTaho

— Florian Krammer (@florian_krammer) September 22, 2020

Au Brésil, le président Jair Bolsonaro a en effet longtemps lié l'ampleur de l'épidémie, même après avoir été infecté au coronavirus. Le pays enregistre aujourd'hui près de 140 000 décès, faisant de lui le deuxième le plus durement touché au monde. Plus de 4,6 millions d'infections y ont également été signalées.

Un coût humain désastreux

Dès le mois de mai, sur le terrain, les soignants se sont retrouvés débordés. À l'apogée de l'épidémie, la ville de Manaus était le théâtre d'images d'hôpitaux débordés, de cadavres entassés dans des camions frigorifiques et de fosses communes. Il est encore difficile d'expliquer concrètement comment les contaminations s'y sont répandues plus rapidement qu'ailleurs. « Les conditions socioéconomiques basses, la surpopulation dans les maisons, l'accès limité à de l'eau potable, la dépendance des voyages sur des bateaux à haut risque (dans lesquels la surpopulation accélère les contagions) » sont de possibles explications, lit-on dans l'étude.

En limitant naturellement les nouvelles infections, l'immunité collective a permis de diminuer le nombre d'infections et de morts d'aujourd'hui. Mais en en causant de très nombreux sur son chemin. Manaus et ses 2,2 millions d'habitants ont enregistré 2 462 décès dus au Covid-19. Rapporté au nombre d'habitants, son taux de mortalité serait le deuxième plus élevé au monde, avec 100,7 décès pour 100 000 habitants.

Dans la plupart des pays d'Amérique latine, eux aussi lourdement heurtés par le virus, le taux de mortalité est bien inférieur, oscillant entre 50 et 65 pour 100 000 habitants, comme au Brésil (65,93) ou en Bolivie (68,83), selon les données de l'Université Johns-Hopkins. En France, le taux de décès pour 100 000 habitants est de 46,94.

Une immunité temporaire

Sur le long terme, l'immunité par infection naturelle ne semble pas vraiment efficace. Selon Lewis Buss, un des chercheurs qui a mené l'étude, « les anticorps contre le SRAS-CoV-2 se désintègrent rapidement, quelques mois après l'infection. Cela se produit clairement à Manaus, ce qui montre l'importance de prendre des mesures sérieuses pour comprendre l'évolution de la maladie », explique-t-il au journal Em Tempo.

Dans leur étude, les chercheurs avertissent leurs lecteurs de légères limites dans leurs tests. Même s'ils ont pris soin d'équilibrer les données pour les rendre aussi représentatives que possible, ils craignent que leur évaluation de la séroprévalence au Covid-19 soit approximative, puisque les données sont issues de dons du sang, procédure qui exclut les enfants, les seniors et les personnes symptomatiques. Toujours selon les chercheurs, la baisse récente des infections à Manaus peut aussi s'expliquer, en partie, par une meilleure application de la distanciation sociale et l'usage de masques.

Gare également à vouloir laisser le virus circuler dans d'autres régions pour atteindre le même taux d'infections et la même immunité. « Nos résultats ne peuvent pas être directement extrapolés dans d'autres contextes, en raison des différences dans la démographie de la population, de son comportement, de sa vulnérabilité aux infections, ainsi que la mise en œuvre et l'adhésion à des mesures non-pharmacologiques », préviennent les chercheurs.

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