Notícia

Jornal da Comunidade

Código para neurociência

Publicado em 24 dezembro 2014

O Centro de Pesquisa, Inovação e Difusão em Neuromatemática (NeuroMat), um dos Centros de Pesquisa, Inovação e Difusão (CEPIDs), apoiados pela Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP), acaba de lançar o primeiro módulo do software livre Neuroscience Experiments System (NES), que auxilia na organização, controle e gerenciamento de dados neurofisiológicos clínicos e experimentais.

 

A primeira versão da ferramenta, foi criada para disponibilizar uma interface para o armazenamento de dados clínicos e avaliações médicas de pacientes e voluntários. Uma  interface faz o gerenciamento dos questionários eletrônicos aplicados nas pesquisas.

 

De acordo com a professora do Departamento de Ciência da Computação do Instituto de Matemática e Estatística da Universidade de São Paulo (IME-USP) e membro do grupo responsável pelo desenvolvimento do NES, o software integra um projeto de construção de um banco de dados neurofisiológicos público, organizado pelo CEPID NeuroMat, uma iniciativa pioneira na área. Essas iniciativas devem facilitar a cooperação entre pesquisadores, diz Kelly Rosa Braghetto.

 

Criado em 2013, o NeuroMat reúne cerca de 50 pesquisadores de áreas como matemática, ciência da computação, estatística, neurociência, biologia, física e comunicação, de universidades brasileiras e estrangeiras. O objetivo do grupo é integrar modelagem matemática e neurociência, em busca de uma maior compreensão do funcionamento do cérebro humano.

 

Kelly Braghetto informa que o primeiro módulo do software NES foi construído usando como modelo os experimentos conduzidos no Instituto de Neurologia Deolindo Couto (INDC), da Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), sob a coordenação da professora Claudia Vargas, uma das pesquisadoras principais do CEPID. O grupo da UFRJ acompanha a reabilitação de pacientes com lesão no plexo braquial, um tipo de lesão neurológica que prejudica o movimento dos braços e das mãos. Esse primeiro módulo foi desenvolvido para cadastrar dados ambulatoriais.

Está em fase de implementação um módulo para o registro de informações dos protocolos experimentais e das medidas fisiológicas coletadas nas pesquisas. Muitas vezes o pesquisador não registra todos os detalhes do protocolo adotado durante a realização do experimento, como determinados parâmetros da configuração dos equipamentos. Esses detalhes podem ter impacto na análise dos dados. O software vai evitar esse tipo de situação, disse Braghetto.

Sistema aberto

Como o código do programa é aberto, os interessados podem baixar e fazer adaptações de acordo com as necessidades de suas pesquisas.

O próximo módulo tem o objetivo de gerenciar dados coletados em exames de neuroimagem.  Haverá um módulo dedicado ao gerenciamento de dados obtidos em experimentos com animais.

A sequência de implementação dos módulos de aquisição de dados do NES será priorizada em função das demandas dos laboratórios associados ao CEPID.

A equipe do NeuroMat espera que, no futuro, as bases de dados de experimentos em neurociência possam ser compartilhadas entre cientistas.